常见的筷子种类有木筷、竹筷、密胺筷、不锈钢筷、仿象牙筷等，但以木制和竹制筷子居多。筷子的选择、存放、清洗不当或超期使用，均会滋生大量细菌，可能引起腹泻、呕吐等病症，甚至可能因黄曲霉素致癌。
实验发现，使用时间越长的筷子，检测出的细菌量越多，而半年更换一次是比较合适的使用周期。
中国医学科学院肿瘤医院副院长蔡建强说，普通筷子在使用3～6个月后，颜色变深，表示材质本身性质已发生变化，而细菌的长期堆积正是其发生颜色变化的主要因素。
如果筷子上出现非竹子或木头本色的斑点，表示该筷子很可能已发霉，不可继续使用。虽然黄曲霉菌多存在于霉变的谷物上，但黄曲霉菌也可能滋生在潮湿、不见光的筷子上。
筷子使用频率高且长期用水清洗，还易滋生幽门螺旋杆菌、黄色葡萄球菌、大肠杆菌等细菌，交叉使用及清洗，又易诱发各类胃肠疾病及肝炎等。因此，建议每周将筷子放入沸水中煮半小时，然后晾晒干燥再使用。此外，最好使用半年就更换，这样就不用过于担心筷子的安全问题。
